2018年臺北科學藝術園區計畫啟動，本館與天文館、兒童新樂園及美崙公園攜手，以道路縫合工程取消原本分隔的街廓，加上2022年底新完工開放之雙溪濕地公園，共構成「臺北科學藝術園區」，以透水鋪面建構海綿城市基盤，打造了開放共享、共融友善的大廣場，增加園區綠覆率及植栽相，並串連起周圍的水岸及河濱綠地，創造媲美第二個大安森林公園的城市休閒空間，以人與自然為本，拉近人與環境的關係。
配合外部空間改變，本館同時調整了相連的公共服務空間，綜合對環境永續、生態教育思考及適地適生的低度維管概念下，參考國外近代景觀及環境永續趨勢（註），採行自然式植栽設計，積極創造生物第二自然棲地，配合空間語彙及特性，搭配栽種河濱長草植栽、耐旱植栽、鄉土植栽、耐陰觀葉植栽、蜜源植物等類型，並將原本舊式無障礙坡道調整成更為寬敞、平緩、共融的緩坡，將原邊緣化的無障礙動線調整為主要動線上，以包覆式的綠植取代牆面及扶手，讓所有遊客均可在此共融環境中無礙的享受這些開放資源。
本館南側入口處以薄層水階梯為意象，重現本館位於基隆河舊河道上的人文歷史脈絡，並藉以調整現地較為酷熱的微氣候條件，以定時辦理生態導覽的方式，帶領觀眾認識這裡的前世今生及生態環境。北側的微型植物園及高架樹屋，以濾鏡、透鏡模擬蜜蜂或貓等的視覺，屋頂空間則設計有實驗花園、生態花園、蜂花園，徹底利用環型廊道、立體動線及各個開放空間，從中創造探索、體驗、玩科學的樂趣，進而與環境產生互動與情感。
註：國外案例參考
The High Line：
https://www.thehighline.org/gardens/
Lincoln Park Zoo Nature Boardwalk ：
https://www.thehighline.org/gardens/
Lurie Garden ：
https://landscapenotes.com/2019/07/12/the-lurie-garden-in-millennium-park-chicago/
Queen elizabeth olympic park：
https://landscapenotes.com/2015/07/17/queen-elizabeth-olympic-park/
The Garden of Pooled Talents：
https://www.nigeldunnett.com/garden-of-pooled-talents/
